O Instituto Politécnico foi criado pelo Decreto 13.937 de 24 de novembro de 1989, como órgão vinculado à Secretaria de Estado de Ciência e Tecnologia do Estado do Rio de Janeiro. Iniciou suas atividades em março de 1990 como uma instituição de pesquisa instalada em Nova Friburgo. Sua localização geográfica estratégica permitiu que seus objetivos se alinhassem ao movimento de interiorização da economia no Estado do Rio de Janeiro.

Em 4 de maio de 1993, o IPRJ foi incorporado à Universidade do Estado do Rio de Janeiro, como Campus Regional - Instituto Politécnico, por intermédio do Decreto 18.641, passando a fazer parte do Programa de Interiorização da Universidade. O Ato Executivo número 14, de 01.06.94, da Reitoria da UERJ, regulamentou as atividades deste Campus Regional.

Em agosto de 1995, iniciaram-se os cursos multidisciplinares de Mestrado e Doutorado em Modelagem Computacional. O programa foi recomendado pela Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) em maio de 1996. Atualmente, possui o conceito 6 na CAPES, que é um conceito excelente, especialmente para cursos fora das principais capitais brasileiras. A pós-graduação em Modelagem Computacional tem suporte financeiro da CAPES, do Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) e da Fundação Carlos Chagas de Amparo à Pesquisa do Estado do Rio de Janeiro (FAPERJ).

Em 23 de setembro de 1996, foi criado o Escritório de Transferência de Tecnologia, que tem como objetivo criar mecanismos para intensificar a interação com a comunidade, sistematizando e aprimorando suas ações, de forma a reduzir a distância existente entre a Universidade e o setor produtivo.

Em 28 de maio de 1997, através da Resolução número 004/97 do Conselho Universitário da UERJ, foi criado o Campus Regional Instituto Politécnico, vinculado à Coordenação dos Campi Regionais.

Ao final de 1998, foi realizado o workshop Planejamento Estratégico IEBTec 2000, que teve por objetivo balizar as ações que seriam realizadas ao longo do biênio 1999-2000, a fim de dotar a IEBTec de condições físicas, técnicas e gerenciais visando torná-la um mecanismo eficaz no apoio à criação e desenvolvimento de um segmento econômico baseado em tecnologias inovadoras na região Centro-Norte Fluminense. Com base neste trabalho, foi tomada a decisão de fundir as ações da IEBTec e do ETT, através da implantação do Núcleo de Desenvolvimento e Difusão Tecnológica (N2TEC), que tem como principal objetivo atuar com foco na difusão das tecnologias geradas em sua instituição-sede, a fim de contribuir para a modernização econômica e o desenvolvimento regional, através da agregação de empreendimentos capazes de cumprir esse papel, seja por meio da própria incubação ou através de processos associativos.

Em 1999, foi implantado o curso de graduação em Engenharia Mecânica, que atualmente conta com a entrada de 80 alunos por ano (40 no primeiro semestre e 40 no segundo). O processo de seleção é feito através do Vestibular da UERJ.

Em 24 de janeiro de 2002, através da Resolução 003/02 do Conselho Universitário da UERJ, foi criada a Unidade Acadêmica Instituto Politécnico com três departamentos: Modelagem Computacional (DMC), Engenharia Mecânica e Energia (DEMEC) e Materiais (DEMAT). Também em 2002, foi criada a Serra Jr. Engenharia, Empresa Júnior do curso de graduação que gradativamente vem desenvolvendo projetos de consultoria para empresas da região.

Em 2006, foi recomendado pela CAPES o curso de pós-graduação stricto sensu, curso de mestrado, de Ciência e Tecnologia de Materiais do Instituto Politécnico. Este programa possui duas áreas de concentração: Materiais Não-Metálicos e Física e Mecânica de Materiais, e iniciou suas atividades no primeiro semestre de 2007. O ingresso de novos alunos ocorre mediante a publicação de Edital próprio elaborado pela Comissão de Pós-graduação do Programa de Ciência e Tecnologia de Materiais.

Em 2007, foi aprovada a criação do curso de graduação em Engenharia de Computação do IPRJ. Este curso iniciou suas atividades em março de 2008 e seleciona, através do Vestibular da UERJ, 40 alunos anualmente (uma única entrada).

Em 2007, foi aprovada a criação do curso de graduação em Engenharia de Computação do IPRJ. Este curso iniciou suas atividades em março de 2008 e seleciona, através do Vestibular da UERJ, 40 alunos anualmente (uma única entrada).

Em janeiro de 2011, devido à tragédia climática que atingiu Nova Friburgo, as antigas instalações do Campus Regional Instituto Politécnico foram duramente atingidas, o que impossibilitou o acesso ao antigo prédio do campus.

Portanto, em função destes acontecimentos, o período letivo de 2011 só pôde ser iniciado em maio daquele ano, com a utilização de parte das instalações da Universidade Estácio em Nova Friburgo, alugadas pela UERJ.

Enquanto isso, o Reitor da UERJ, com o apoio do Secretário de Ciência e Tecnologia do Estado do Rio de Janeiro, assinou um contrato de locação com opção de compra de dois prédios de 3 andares do Complexo Industrial Triumph International - Filó S.A.

Em 2014, os dois prédios alugados foram adquiridos, com recursos do Governo do Estado do Rio de Janeiro, juntamente com outros dois prédios e o estacionamento da antiga área industrial.